水晶的应用范围相当广泛。作为药物，用它“慰目，除热泪”，李时珍用它作“入点目药，穿串吞咽中，推引诸硬物”。
水晶是光学仪器材料，可用来制作眼睛片、放大镜等。水晶制品从外表上看和玻璃相差不多，但是普通的玻璃杯子加热后扔到冷水中，杯子很容易炸裂，如果是水晶杯子，就不会出现炸裂现象。
水晶可以制作成水晶球、玉雕制品、无色或者改色的原料。水晶是工艺美术品的贵重原材料。水胆水晶内有肉眼可以看见的含水包裏体。